Concevoir et optimiser des produits biothérapeutiques
Associer la puissance de l'IA à des workflows physiques pour des produits biologiques de nouvelle génération
Faire progresser la découverte de produits biologiques grâce à l'IA et à la modélisation moléculaire
Dans une industrie des biothérapies en constante évolution, la précision et la rapidité sont essentielles. Les méthodes basées sur l'IA transforment la façon dont les chercheurs abordent les tâches complexes et elles facilitent la découverte de nouvelles thérapies. En intégrant des modèles d'IA de pointe (AlphaFold2/OpenFold, RFDiffusion et la famille de modèles ProteinMPNN), Discovery Studio Simulation sur la plate-forme 3DEXPERIENCE® permet aux spécialistes de la modélisation moléculaire et de la biologie computationnelle de passer de l'idéation à des têtes de série potentielles optimisées avec une efficacité accrue. Ils peuvent ainsi identifier les meilleurs candidats biothérapeutiques plus rapidement et à moindre coût.
En tant qu'application SaaS (Software-as-a-Service), Discovery Studio Simulation permet d'accéder facilement à ces méthodes puissantes sans avoir besoin de matériel coûteux ni d'une expertise technique. Grâce à son interface conviviale, les utilisateurs peuvent associer le deep learning à la modélisation physique dans un workflow unifié, ce qui leur permet de gérer sans effort des tâches de calcul haute performance complexes.
Conception générative de produits biologiques sur 3DEXPERIENCE
Discovery Studio Simulation permet désormais d'accéder à RFDiffusion afin de concevoir de nouveaux échafaudages protéiniques intégrant un motif connu, ainsi qu'à la famille de modèles ProteinMPNN afin de générer de nouvelles bibliothèques de séquences de protéines pour une structure donnée. Associés à AlphaFold2/OpenFold, ces modèles étendent la gamme de solutions puissantes basées sur l'IA qu'offre BIOVIA sur la plate-forme 3DEXPERIENCE. Ils aident ainsi les spécialistes de la biologie computationnelle à explorer un espace biologique plus vaste pour découvrir de nouvelles biothérapies.
Prédiction de structures avec l'intelligence artificielle
Discovery Studio Simulation propose OpenFold pour la prédiction de structures monomères et AlphaFold2 pour la prédiction de structures multimères sur la plate-forme 3DEXPERIENCE. En associant ces modèles à des approches physiques dans une même application, Discovery Studio Simulation permet aux scientifiques d'affiner les structures générées par l'IA à l'aide de simulations de dynamique moléculaire. Pour optimiser leurs têtes de série potentielles, ils peuvent également suivre les workflows en aval tels que le criblage virtuel par amarrage, l'échantillonnage d'états conformationnels avec une dynamique moléculaire améliorée ou l'étude des propriétés des formulations de protéines.
Workflows physiques complets pour la découverte de produits biothérapeutiques
Discovery Studio Simulation est une solution de modélisation moléculaire tout-en-un qui offre flexibilité et polyvalence pour la conception et l'optimisation de produits biothérapeutiques de haute qualité. En aidant les chercheurs depuis la prédiction des structures jusqu'à la cartographie d'épitopes, la maturation d'affinité, l'humanisation, la prédiction de solubilité et la formulation d'excipients, elle propose des workflows in silico complets et des méthodes de calcul de pointe. Avec Discovery Studio Simulation, les chercheurs peuvent se concentrer sur les candidats les plus susceptibles de réussir les essais cliniques et ainsi raccourcir les délais, réduire les coûts et rationaliser le processus traditionnellement fastidieux de découverte de produits biothérapeutiques.
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FAQ sur les solutions biothérapeutiques
Les produits biothérapeutiques, également appelés biothérapies ou produits biologiques, sont dérivés d'organismes vivants. Ils comprennent les anticorps monoclonaux, les thérapies à base d'anticorps (par exemple, les conjugués anticorps-médicament, les anticorps bispécifiques), les vaccins, les thérapies cellulaires et génétiques, et bien plus encore. Les produits biothérapeutiques sont généralement plus grands et plus complexes que les médicaments traditionnels à petites molécules. En raison de leur spécificité et de leur capacité à cibler des voies complexes, ils sont utilisés pour traiter de nombreuses maladies comme le cancer, les maladies auto-immunes ou les affections neurologiques.
Discovery Studio Simulation est une application SaaS disponible sur la plate-forme 3DEXPERIENCE. Elle permet aux utilisateurs d'associer le deep learning à la modélisation physique pour la découverte de médicaments, le tout dans une interface conviviale. Elle propose notamment des méthodes de prédiction de la structure des protéines, de simulation de dynamique moléculaire (MD), de cartographie d'épitopes et d'humanisation. Cette plate-forme complète aide les chercheurs tout au long de la découverte et l'optimisation de produits biothérapeutiques en permettant de réduire les coûts et de raccourcir les délais.
En plus de MODELER, algorithme de modélisation par homologie depuis longtemps considéré comme leader sur le marché, Discovery Studio Simulation propose le modèle d'IA AlphaFold2, récompensé par un prix Nobel, pour la prédiction de structures multimères. Dassault Systèmes est également membre de l'OpenFold Consortium et propose OpenFold pour la prédiction de structures monomères. Les utilisateurs peuvent associer ces modèles à des simulations MD pour affiner les structures générées par l'IA et/ou prendre en charge les workflows en aval, tels que l'amarrage, l'échantillonnage conformationnel et les études de formulation de protéines, afin d'optimiser leurs têtes de série potentielles.
Oui, en tant qu'application SaaS, Discovery Studio Simulation élimine le besoin de matériel coûteux ou d'une expertise technique approfondie. Son interface basée sur le cloud fournit un accès transparent au calcul haute performance, ce qui permet aux chercheurs d'effectuer des tâches complexes sans effort.
La plate-forme prend en charge une gamme de workflows essentiels pour la recherche et le développement de processus biothérapeutiques, notamment :
- Prédiction de la structure des protéines
- Cartographie d'épitopes et maturation d'affinité
- Humanisation d'anticorps
- Prédiction de solubilité et formulation d'excipient
- Analyse de l'interaction protéine-protéine et amarrage
En intégrant l'IA et la modélisation physique, Discovery Studio Simulation permet de rationaliser la découverte de produits biothérapeutiques. Il aide les chercheurs à identifier les meilleurs candidats avant de passer aux tests expérimentaux. C'est ainsi que les équipes peuvent réduire le temps et les coûts associés à la découverte de produits biothérapeutiques.
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