Predicting Protein Ensembles with Deep Learning Models in Discovery Studio Simulation | Dassault Systèmes
Watch the replay to learn how you can explore the conformational space of proteins in Discovery Studio Simulation.
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Concevoir et optimiser des produits biothérapeutiques
La puissance de l'IA et des mécanismes physiques au service des biomédicaments nouvelle génération
Faire progresser la découverte de produits biologiques grâce à l'IA et à la modélisation moléculaire
Dans une industrie des biothérapies en constante évolution, la précision et la rapidité sont essentielles. Les méthodes basées sur l'IA transforment la façon dont les chercheurs abordent les tâches complexes et elles facilitent la découverte de nouvelles thérapies. En intégrant des modèles d'IA de pointe (AlphaFold2/OpenFold, RFDiffusion et la famille de modèles ProteinMPNN), Discovery Studio Simulation sur la plate-forme 3DEXPERIENCE® permet aux spécialistes de la modélisation moléculaire et de la biologie computationnelle de passer de l'idéation à des têtes de série potentielles optimisées avec une efficacité accrue. Ils peuvent ainsi identifier les meilleurs candidats biothérapeutiques plus rapidement et à moindre coût.
En tant qu'application SaaS (Software-as-a-Service), Discovery Studio Simulation permet d'accéder facilement à ces méthodes puissantes sans avoir besoin de matériel coûteux ni d'une expertise technique. Grâce à son interface conviviale, les utilisateurs peuvent associer le deep learning à la modélisation physique dans un workflow unifié, ce qui leur permet de gérer sans effort des tâches de calcul haute performance complexes.
Conception générative de produits biologiques sur 3DEXPERIENCE
Discovery Studio Simulation permet désormais d'accéder à RFDiffusion afin de concevoir de nouveaux échafaudages protéiniques intégrant un motif connu, ainsi qu'à la famille de modèles ProteinMPNN afin de générer de nouvelles bibliothèques de séquences de protéines pour une structure donnée. Associés à AlphaFold2/OpenFold, ces modèles étendent la gamme de solutions puissantes basées sur l'IA qu'offre BIOVIA sur la plate-forme 3DEXPERIENCE. Ils aident ainsi les spécialistes de la biologie computationnelle à explorer un espace biologique plus vaste pour découvrir de nouvelles biothérapies.
Prédiction de structures avec l'intelligence artificielle
Discovery Studio Simulation propose OpenFold pour la prédiction de structures monomères et AlphaFold2 pour la prédiction de structures multimères sur la plate-forme 3DEXPERIENCE. En associant ces modèles à des approches physiques dans une même application, Discovery Studio Simulation permet aux scientifiques d'affiner les structures générées par l'IA à l'aide de simulations de dynamique moléculaire. Pour optimiser leurs têtes de série potentielles, ils peuvent également suivre les workflows en aval tels que le criblage virtuel par amarrage, l'échantillonnage d'états conformationnels avec une dynamique moléculaire améliorée ou l'étude des propriétés des formulations de protéines.
Workflows physiques complets pour la découverte de produits biothérapeutiques
Discovery Studio Simulation est une solution de modélisation moléculaire tout-en-un qui offre flexibilité et polyvalence pour la conception et l'optimisation de produits biothérapeutiques de haute qualité. En aidant les chercheurs depuis la prédiction des structures jusqu'à la cartographie d'épitopes, la maturation d'affinité, l'humanisation, la prédiction de solubilité et la formulation d'excipients, elle propose des workflows in silico complets et des méthodes de calcul de pointe. Avec Discovery Studio Simulation, les chercheurs peuvent se concentrer sur les candidats les plus susceptibles de réussir les essais cliniques et ainsi raccourcir les délais, réduire les coûts et rationaliser le processus traditionnellement fastidieux de découverte de produits biothérapeutiques.
Générer des structures de protéines 3D avec MODELER
Affiner les structures 3D dérivées d'OpenFold/AlphaFold2 à l'aide de simulations de dynamique moléculaire
Rechercher efficacement des schémas d'interaction protéine-protéine et générer les poses d'amarrage possibles avec ZDOCK
Générer des rapports d'humanisation interactifs avec des détails sur les mutations possibles en fonction des cellules germinales et/ou du type de résidus fréquents d'un modèle ML publié
Prédire les interactions des excipients à l'aide d'un algorithme ML publié
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Le monde de la conception de produits biothérapeutiques évolue. Découvrez comment garder une longueur d'avance avec BIOVIA.
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Conception de produits thérapeutiques à petites molécules
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