Vratin Srivastava just completed a successful summer internship on computational protein design within the Protein Modeling and Simulation team at BIOVIA....
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Kombination von KI-Leistung und physikbasierten Workflows für Biologika der nächsten Generation
Präzision und Geschwindigkeit sind in der sich schnell entwickelnden Landschaft der biologischen Therapien von heute entscheidend. KI-gesteuerte Methoden verändern die Herangehensweise von Forschern an komplexe Aufgaben und beschleunigen die Erforschung neuer Therapeutika. Durch die Integration modernster KI-Modelle, wie die Modellfamilien AlphaFold2/OpenFold, RFDiffusion und ProteinMPNN, ermöglicht Discovery Studio Simulation auf der 3DEXPERIENCE® Plattform Molekularmodellierern und Computerbiologen den Übergang von der Konzeption hin zu optimierten Leitstruktur-Kandidaten. Sie arbeiten effizienter und können die besten Biotherapeutika-Kandidaten bei geringeren Kosten schneller ermitteln.
Als SaaS-Anwendung (Software-as-a-Service) ermöglicht Discovery Studio Simulation die Nutzung dieser leistungsfähigen Methoden, ohne dass teure Hardware oder technisches Fachwissen erforderlich sind. Über die benutzerfreundliche Oberfläche können Anwender Deep Learning mit physikbasierter Modellierung in einem einheitlichen Workflow kombinieren und mühelos komplexe Berechnungsaufgaben bewältigen, die High-Performance Computing erfordern.
Discovery Studio Simulation bietet jetzt Zugriff auf RFDiffusion für die Entwicklung neuer Proteingerüste, die ein bekanntes Motiv enthalten, und auf die ProteinMPNN-Modellfamilie zur Erstellung neuartiger Proteinsequenzbibliotheken für eine vorgegebene Struktur. Zusammen mit AlphaFold2/OpenFold erweitern diese Modelle die ständig wachsende Palette an leistungsstarken KI-gesteuerten Lösungen von BIOVIA auf der 3DEXPERIENCE Plattform und helfen Computerbiologen, einen größeren biologischen Raum für die Erforschung neuartiger Biotherapeutika zu erkunden.
Discovery Studio Simulation bietet OpenFold für die Monomer-Strukturvorhersage und AlphaFold2 für die Multimer-Strukturvorhersage auf der 3DEXPERIENCE Plattform. Durch die Kombination dieser Modelle mit physikbasierten Ansätzen in nur einer Anwendung ermöglicht Discovery Studio Simulation es Wissenschaftlern, ihre KI-generierten Strukturen mit Molekulardynamik-Simulationen zu verfeinern und nachgelagerte Workflows zur Optimierung ihrer Leitstruktur-Kandidaten zu verfolgen, wie z. B. virtuelles Screening über Docking, Probenahme von Konformationszuständen mit verbesserter molekularer Probendynamik oder Untersuchung der Eigenschaften von Proteinformulierungen.
Discovery Studio Simulation ist eine All-in-One-Lösung für die molekulare Modellierung, die Flexibilität und Vielseitigkeit bei der Entwicklung und Optimierung von hochwertigen Biotherapeutika bietet. Durch die Unterstützung von Forschern von der Strukturvorhersage bis zur Epitopkartierung, Affinitätsreifung, Humanisierung, Löslichkeitsvorhersage und Hilfsstoffformulierung bietet sie vollständigeIn-silico-Workflows mit branchenführenden Berechnungsmethoden. Mit Discovery Studio Simulation konzentrieren sich Forscher auf Kandidaten, die in klinischen Studien am ehesten erfolgreich sein werden, verkürzen die Entwicklungszeit, senken Kosten und optimieren den traditionell arbeitsintensiven Prozess der Erforschung von Biotherapeutika.
Die Welt der Biotherapeutika-Entwicklung verändert sich. Erfahren Sie, wie Sie mit BIOVIA immer einen Schritt voraus bleiben.
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