# 리간드 및 약물 기반 설계

*신규* 약물 설계, 다중 대상 약물 설계 및 활동 프로파일링

Discovery Studio 2023 SP1 | 소분자의 새로운 내용

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1분 9초

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(BIOVIA Pharmacophore Design - Rich Text)업계 최고의 도구로 소분자 치료제 설계 강화

단백질과 리간드의 결합 상호작용은 다양한 입체 및 전기화학 요소에서 기인합니다. 이러한 상호작용을 이해하면 연구원들은 더 빠르게 유망한 신규 치료제 후보를 식별할 수 있습니다. 약물 분자구조는 이러한 기능을 3D 공간에 표시하여 가상으로 화합물 라이브러리를 간단하게 조회하고, 기존 리드의 결합을 특징 지으며, 성능을 최적화합니다.

[BIOVIA Discovery Studio](/ko/products/biovia/discovery-studio "BIOVIA Discovery Studio")는 CATALYST Pharmacophore Modeling and Analysis 도구 모음을 활용하여 구조화된 대상 데이터 유무와 관계없이 소분자 치료제 평가를 지원합니다. 이는 신규 약물 설계, 다중 대상 약물 설계 및 활동 프로파일링을 지원하여 소분자 R&D를 추진합니다.

구축

구축(rich text)

- 사용 가능한 데이터에서 자동으로 약물 분자구조 생성
    - 활성 리간드 세트
    - 수용체 결합 지점
    - 수용체-리간드 복합체
- 알려진 활동을 가진 제어 화합물 세트를 기반으로 엄격한 약물 분자구조 검증을 수행합니다.
- 가설에는 다음이 포함될 수 있습니다.
    - 기하학적 기능 기반 쿼리
    - 형상 유사성
    - "금지" 공간
- 다중 활성 모드의 위험이 있는 매우 크고 다양한 화합물 세트에 대한 조화 약물 분자구조를 탐색하여 기존의 약물 분자구조 설명 알고리즘의 제한을 뛰어넘습니다.

적용

적용(Rich Text)

견고한 약물 분자구조 선별 연구 수행

- 3D 형태의 데이터베이스 구축 및 검색
- 리간드의 전체 형태 공간 고려 및 분석
- PharmaDB\* 데이터베이스를 사용하여 목표를 벗어난 활동 및 약물 목적 변경 탐색

Discovery Studio는 이제 리간드 프로파일링에 대해 가장 광범위하게 보고된 데이터베이스를 포함합니다. scPDB\*에서 구축되고 이를 통해 검증된 PharmaDB는 약 240,000개의 수용기-리간드 약물 분자구조 모델을 포함합니다.

[   sc-PDB에 대해 자세히 알아보기     ](http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr/scPDB/)

설계

설계(Rich Text)

리간드와 결합 라이브러리 설계 및 특성화

- 반응 또는 코어 기반 라이브러리 열거
- 이온화 상태, 호변체 및 이성체 열거
- 바람직하지 않은 기능 그룹 및 Lipinski and Verber 규칙 또는 자체 기준으로 문제가 있는 후보 필터링
- 다양한 물리화학 및 고유한 특성 계산
- Pareto 최적화, 다양성 및 유사성 분석을 사용하여 결합 라이브러리 최적화
- PCA 분석을 사용하는 클러스터링 도구 및 3D 시각화

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