# Diseño basado en la estructura

Cartera completa y escalable de herramientas científicas para respaldar el diseño basado en estructuras y en fragmentos

(BIOVIA Structure-Based Design - Rich Text)Facilite el descubrimiento de fármacos, desde el descubrimiento de aciertos hasta la optimización en las últimas fases

El diseño basado en la estructura (SBD) y el diseño basado en fragmentos relacionados (FBD) son estrategias muy asentadas en el desarrollo racional de fármacos de moléculas pequeñas. El conocimiento de cómo una molécula pequeña se une a una proteína ofrece ventajas considerables, tanto para priorizar compuestos para el cribado en las primeras fases como para optimizar la potencia y la selectividad.

[BIOVIA Discovery Studio](/es/products/biovia/discovery-studio "BIOVIA Discovery Studio") ofrece una cartera completa y escalable de herramientas científicas, como GOLD del Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC), para respaldar y ayudar en las estrategias de SBD y FBD, desde el descubrimiento de aciertos hasta la optimización de candidatos en las últimas fases.

(BIOVIA Structure-based Design Panel)Preparar

Preparar (Rich Text)

- Analice y prepare estructuras 3D (por ejemplo, PDB, estructura de rayos X, modelo de homología) para SBD.
- Cree automáticamente moléculas vecinas basadas en el empaquetado de cristales y analice sus interacciones.
- Pronostique los estados de ionización de residuos con el pH elegido.
- Identifique y estudie los supuestos sitios de unión de ligandos.
- Prepare ligandos con un amplio conjunto de características y calcule las coordenadas 3D.
- Genere conformaciones de ligandos.
- Filtre los ligandos en función de la similitud de los fármacos, las propiedades moleculares o para eliminar grupos o características no deseados.

(BIOVIA Structure-based Design Panel)Cribado

Cribado (Rich Text)

- Identificación y optimización de aciertos
- Realice un cribado virtual de ligandos y fragmentos utilizando el motor de farmacóforos CATALYST o los métodos de acoplamiento LibDock o CDOCKER.
- Realice el acoplamiento con GOLD §.
- Realice la optimización de candidatos in situ utilizando transformaciones de reacciones de química farmacéutica clásicas y reactivos disponibles en el mercado.
- Identifique los núcleos estructurales o realice sustituciones del grupo R in situ utilizando fragmentos moleculares derivados de compuestos disponibles en el mercado.

*§ Requiere licencia del [Cambridge Crystallographic Data Centre](https://www.ccdc.cam.ac.uk/)*

(BIOVIA Structure-based Design Panel)Puntaje

Puntaje (Rich Text)

- Calcule las energías de unión con métodos basados en CHARMm MM-PBSA o MM-GBSA.
- Pronostique con precisión la energía relativa de unión del ligando para una serie de ligandos congenéricos utilizando el método de perturbación de energía libre (FEP).
- Calcule la energía libre relativa de unión para una biblioteca combinatoria de ligandos modelada por Multi-Site Lambda Dynamics (MSLD).
- Identifique los residuos críticos que interactúan mediante un conjunto completo de monitores no enlazados favorables, desfavorables e insatisfactorios.
- Perfile y priorice los resultados del cribado, optimizando la potencia y la especificidad del objetivo.

(BIOVIA Structure-based Design Panel)Extender

Extender (Rich Text)

- Diseñe y optimice bibliotecas combinatorias como nuevos puntos de partida para el cribado posterior.
- Combine sus puntajes con los descriptores basados en [QSAR clásicos](/es/products/biovia/discovery-studio/qsar-admet-predictive-toxicology "QSAR, ADMET y toxicología predictiva"), huellas dactilares y mecánica cuántica y cree modelos predictivos avanzados.
- Reduzca al mínimo la toxicidad con TOPKAT y optimice el perfil farmacocinético.

## (Structure-based Design - Marketing asset WOC)Comience su viaje

Acelere el descubrimiento de fármacos con BIOVIA Discovery Studio.

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